Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Mid2Q9QUS6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mid2Q9QUS6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mid2Q9QUS6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mid2Q9QUS6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Mid2Q9QUS6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mid2Q9QUS6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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