Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gfra4Q9JJT2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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