Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ccl28Q9JIL2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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