Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rb1cc1Q9ESK9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rb1cc1Q9ESK9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
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Rb1cc1Q9ESK9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rb1cc1Q9ESK9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms