Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Rnft1Q9DCN7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnft1Q9DCN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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