Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf6Q9DBU5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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