Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tvp23bQ9D8T4 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms