Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms