Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MsraQ9D6Y7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MsraQ9D6Y7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms