Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms