Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrameQ9D4Z5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms