Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Krt20Q9D312 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Krt20Q9D312 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Krt20Q9D312 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Krt20Q9D312 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms