Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Trappc6bQ9D289 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trappc6bQ9D289 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Trappc6bQ9D289 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trappc6bQ9D289 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms