Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fcf1Q9CTH6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms