Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl41Q9CQN7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms