Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccer1Q9CQL2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccer1Q9CQL2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms