Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9CQC3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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