Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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