Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms