Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl27Q99N92 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms