Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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