Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ciao1Q99KN2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ciao1Q99KN2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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