Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pacsin3Q99JB8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms