Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Apobec3Q99J72 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms