Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
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