Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf144aQ925F3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms