Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Pth2Q91W27 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pth2Q91W27 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms