Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms