Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ubxn4Q8VCH8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ubxn4Q8VCH8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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