Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4I3

Arhgef6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef6Q8K4I3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef6Q8K4I3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef6Q8K4I3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms