Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OptnQ8K3K8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms