Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Abcf3Q8K268 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Abcf3Q8K268 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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