Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Upp2Q8CGR7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Upp2Q8CGR7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Upp2Q8CGR7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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