Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup88Q8CEC0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms