Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms