Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp44Q8C2S0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms