Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcaphQ8C156 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms