Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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