Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmod1Q8BVA4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms