Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rnf41Q8BH75 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf41Q8BH75 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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