Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf139Q7TMV1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf139Q7TMV1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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