Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vma21Q78T54 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms