Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Sys1Q78S06 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Sys1Q78S06 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms