Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms