Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Eci3Q78JN3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms