Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Kcnt1Q6ZPR4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Kcnt1Q6ZPR4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Kcnt1Q6ZPR4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Kcnt1Q6ZPR4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms