Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm29Q6PDI5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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