Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbtb40Q6PCS8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Zbtb40Q6PCS8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms