Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CltbQ6IRU5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms