Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usf2Q64705 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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